排除TORQUE qsub请求中的特定节点

Question

我的园区中的集群使用PBS TORQUE进行作业管理。

在软件中有几个节点是过时的。如果我的作业被发送到其中一个节点，它将失败。有没有办法排除作业请求中的特定节点(或节点列表)？

Answer 1

我不确定您是否可以指定您的作业可以从中选择的集合。您可以指定节点列表，但您必须等待所有节点都变为空闲状态，然后才能运行作业。根据需要排除的节点数量，您可以执行以下操作。

cat $PBS_NODEFILE | grep -v badnode1 |grep -v badnode2 > goodnodes NP=wc -l goodnodes #need back ticks around "wc -l goodnodes" mpirun -np $NP -machinefile goodnodes ./a.out

如果您以任何方式收取资源费用，这并不是理想的做法，但它应该可以帮助您运行作业。