PypeR问题“未定义全局名称'dump_stdout‘”

Question

提前向您问候和感谢。

我正在尝试用Python语言运行一个非常简单的代码，使用PypeR模块在我的Python语言代码中运行R脚本：

#Writing Some Python Code to interface with R

from pyper import *
import sys
import os
import pandas
import glob
import subprocess
import numpy

outputs = runR("a <- 3; print(a+5)")

它会导致以下错误：

Traceback (most recent call last):
  File "C:/Users/gavefl1/Documents/GitHub/Git_R_Test/NewRepo_Python_R/Python_R/MasterFile.py", line 14, in <module>
    outputs = runR("a <- 3; print(a+5)")
  File "C:\Python27\lib\site-packages\pyper.py", line 793, in runR
    Robj = R(RCMD=Robj, max_len=max_len, use_numpy=use_numpy, use_pandas=use_pandas, use_dict=use_dict, host=host, user=user, ssh=ssh, dump_stdout=dump_stdout)
NameError: global name 'dump_stdout' is not defined

我试着查看了实际的PypeR.py代码，但据我所知'dump_stdout‘是定义的。我的系统规格如下。再次感谢：

Windows 7 64位Python2.7.8 Visual Studio2008(我了解到这是运行Python的最佳Visual Studio包)R 3.1.1 PypeR 1.1.2

Answer 1

我想你的例子来自这里：http://www.jstatsoft.org/v35/c02/paper

该文章发表于2010年，很可能对应于v1.0 https://pypi.python.org/pypi/PypeR/1.0

您可以按如下方式安装pyper v.1.0。

pip uninstall pyper
pip install pyper==1.0

也就是说，您可以通过执行以下操作在当前版本(1.1.2)中获得相同的结果：

>>> r = R()
>>> outputs = r.("a <- 3; print(a+5)")
>>> outputs
'try({a <- 3; print(a+5)})\n[1] 8\n'

在1.0版本中，结果是：

>>> outputs = runR('a <- 3; print(a+5)')
>>> outputs
'try({a <- 3; print(a+5)})\n[1] 8\n'