Python regionprops sci-kit图像

Question

我正在使用sci-kit image来获取分割图像的"regionprops“。然后，我希望将每个段标签替换为其相应的统计数据(例如，偏心率)。

from skimage import segmentation
from skimage.measure import regionprops

#a segmented image
labels = segmentation.slic(img1, compactness=10, n_segments=200)
propimage = labels
#props loop
for region in regionprops(labels1, properties ='eccentricity') :
    eccentricity = region.eccentricity 
    propimage[propimage==region] = eccentricity

这将运行，但propimage值不会从其原始标签更改

我也尝试过：

for i in range(0,max(labels)):
     prop = regions[i].eccentricity #the way to cal a single prop
     propimage[i]= prop

这就产生了这个错误ValueError:包含多个元素的数组的真值是不明确的。使用a.any()或a.all()

我是最近从matlab迁移过来的，我在那里实现了这一点，但使用的数据结构完全不同。

有人能帮我这个忙吗？

谢谢

Answer 1

使用ndimage from scipy : sum()函数可以使用您的标签数组进行操作。

from scipy import ndimage as nd
sizes = nd.sum(label_file[0]>0, labels=label_file[0], index=np.arange(0,label_file[1])

然后，您可以使用numpy.histogram等工具评估该发行版。