NetworkX --创建属于4节点集团的所有节点的新图

Question

我有一个网络，我想通过派系来绑定，但我还没有完全弄清楚如何正确地做到这一点。我可以使用k-core来完成同样的过程，但不确定创建一个只包含团的图的正确过程是什么。

我希望，如果我展示了使用k_core函数查找子图的过程，有人可以帮助我更改我的过程，使用clique函数查找子图。

首先，我创建了一个图表，我将使用空手道俱乐部的图表：

In [1]: import networkx as nx

In [2]: g = nx.karate_club_graph()

在iPython中绘制图形：

In [3]: pylab inline
Populating the interactive namespace from numpy and matplotlib

In [4]: nx.draw(g)

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接下来，我找到4核内的所有边(有4个或更多的边)：

In [5]: g_4k_edges = nx.k_core(g, k=4).edges()

将这些边添加到新图中：

In [6]: g_4k = nx.Graph()
In [7]: g_4k.add_edges_from(g_4k_edges)

绘制4核图：

In [8]: nx.draw(g_4k)

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你知道如何做到这一点吗，但不是使用k- more来限制网络，而是使用具有4个或更多顶点的集团？

Answer 1

这里有一种使用团生成子图的方法。

import networkx as nx

g = nx.karate_club_graph()

查找包含4个或更多节点的所有集团：

cliques = nx.find_cliques(g)
cliques4 = [clq for clq in cliques if len(clq) >= 4]

从所有足够大的集团中创建g的子图：

nodes = set(n for clq in cliques4 for n in clq)
h = g.subgraph(nodes)

丢弃h中度小于4的节点：

deg = nx.degree(h)
nodes = [n for n in nodes if deg[n] >= 4]

所需的图k是包含以下节点的h的子图：

k = h.subgraph(nodes)

以下是所需图形的图像：

nx.draw(k)

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