R中的Groupby bin和aggregate

Question

我有像(a，b，c)这样的数据

a b c
1 2 1
2 3 1
9 2 2
1 6 2

其中'a‘范围被划分为n个(比如3)相等的部分，聚合函数计算b值(比如max)，并按'c’进行分组。

所以输出看起来像这样

a_bin  b_m(c=1) b_m(c=2)
1-3     3          6
4-6     NaN        NaN
7-9     NaN        2

哪一项是所有范围，其中a箱的样本、N=unique c样本或所有范围

我该怎么做呢？有没有什么R包可以帮我呢？

Answer 1

aggregate、cut和reshape的组合似乎可以工作

df <- data.frame(a = c(1,2,9,1),
                 b = c(2,3,2,6),
                 c = c(1,1,2,2))

breaks <- c(0, 3, 6, 9)

# Aggregate data
ag <- aggregate(df$b, FUN=max,
                by=list(a=cut(df$a, breaks, include.lowest=T), c=df$c))

# Reshape data
res <- reshape(ag, idvar="a", timevar="c", direction="wide")

Answer 2

会有更简单的方法。

如果数据集为dat

res <- sapply(split(dat[, -3], dat$c), function(x) {
a_bin <- with(x, cut(a, breaks = c(1, 3, 6, 9), include.lowest = T, labels = c("1-3", 
    "4-6", "7-9")))
c(by(x$b, a_bin, FUN = max))
})
res1 <- setNames(data.frame(row.names(res), res), 
        c("a_bin", "b_m(c=1)", "b_m(c=2)"))
row.names(res1) <- 1:nrow(res1)

 res1
 a_bin b_m(c=1) b_m(c=2)
1   1-3        3        6
2   4-6       NA       NA
3   7-9       NA        2

Answer 3

我将使用data.table和reshape2的组合，它们都针对速度进行了充分的优化(而不是使用apply系列的for循环)。

输出不会返回未使用的回收站。

v <- c(1, 4, 7, 10) # creating bins 
temp$int <- findInterval(temp$a, v)

library(data.table)
temp <- setDT(temp)[, list(b_m = max(b)), by = c("c", "int")]

library(reshape2)
temp <- dcast.data.table(temp, int ~ c, value.var = "b_m")
## colnames(temp) <- c("a_bin", "b_m(c=1)", "b_m(c=2)") # Optional for prettier table
## temp$a_bin<- c("1-3", "7-9") # Optional for prettier table

##   a_bin b_m(c=1) b_m(c=2)
## 1   1-3        3        6
## 2   7-9       NA        2