通过XGrid运行BLAST

Question

有谁有使用XGrid运行BLAST的经验吗？

谷歌搜索显示，有一个名为“Xgrid BLAST”的工具存在，但不知道从哪里获取。

Answer 1

BLAST包含在Xgrid中。引用“Utilization of a Local Grid of Mac OS X-Based Computers using Xgrid”的话：

Xgrid 包括一个强大的、可定制的、通用的作业提交界面和 Xgrid BLAST，这是一个基于 Xgrid 技术的全功能、支持网格的应用程序，它运行 NCBI BLAST 局部对齐搜索算法工具的实例。

安装Xgrid后，您可以在任何客户端计算机上打开/Applications/Xgrid BLAST.app。

有关详细信息，请参阅：

• the Xgrid installation documentation by the University of Utah.
• How to use Apple's xgrid for running BLAST jobs由 NACS 研究计算支持小组
• Xgrid basics由爱丁堡大学进化生物学研究所的Blaxter实验室提供的研究计算支持。它包含一个示例Perl file，用于将BLAST作业提交到Xgrid。

最后一点提示，如果你对未来有任何与生物信息学相关的问题，有一个专门针对生物信息学家的StackOverflow克隆，叫做BioStars。你可能会得到一个更快的答案。