Incanter-numpy互操作

Question

我想使用Clojure的Incanter，但我想混合调用Python的大量Numpy/Scipy数值库。在Incanter和Numpy之间是否有一个互操作性的桥梁，允许从Clojure运行CPython的嵌入式运行时，并将Numpy和Incanter的矩阵数据结构相互转换？

Jython是不够的，因为Numpy需要CPython。

我知道(但从未使用过) http://jepp.sourceforge.net/，它允许Java程序控制嵌入式CPython运行时--但是仍然需要Numpy/Incanter矩阵的相互转换。

我正在寻找类似于https://github.com/jolby/rincanter的东西(我也还没有使用过)，但用于CPython/Numpy而不是R。

Answer 1

没有现成的numpy-incanter桥。你必须写你自己的。

一种方法是使用JNI resp。Jepp和-正如您已经说过的-将原始ndarray字节转换为Java Colt库可以使用的内容(反之亦然；incanter构建于Colt之上)。此外，您还包装了您感兴趣的所有函数。

另一种方法是序列化ndarray，并在CPython和Jython之间发送它们(例如，使用CPython和Jython：http://packages.python.org/Pyro4/alternative.html#jython的Pyro )。同样，您必须将原始字节转换为Incanter resp。numpy可以理解，但是您可以在Java端使用Python代码，而不需要使用JNI将每个函数包装在numpy/scipy中。