RCaller Java过早结束文件又名XML文件为空

Question

我正在使用RCaller 2.1.1-SNAPSHOT编写程序。问题是，当我使用外部库中的代码时，它显示Routput file为空。下面是我的代码：

  Random random = new Random();


  RCaller caller = new RCaller();
  RCode code = new RCode();

  caller.setRscriptExecutable("C:/Program Files/R/R-2.14.2/bin/x64/Rscript.exe");

  double[] data = new double[100];

  for (int i = 0; i < data.length; i++) {
    data[i] = random.nextGaussian();
  }

  code.addDoubleArray("x", data);

  code.addRCode("setwd('C:/Radek/')");
  code.addRCode("wd=list.files()");
  code.addRCode("library(Biobase)");
  //code.addRCode("targets=read.AnnotatedDataFrame('targets.txt',row.names=1,as.is=TRUE)");// WHEN I USE THIS IT CRASH
  code.addRCode("my.mean<-mean(x)");
  code.addRCode("my.var<-var(x)");
  code.addRCode("my.sd<-sd(x)");
  code.addRCode("my.min<-min(x)");
  code.addRCode("my.max<-max(x)");
  code.addRCode("my.standardized<-scale(x)");

  code.addRCode(
          "my.all<-list(mean=my.mean, variance=my.var, sd=my.sd, min=my.min, max=my.max, std=my.standardized)");
  caller.setRCode(code);
  caller.runAndReturnResult("wd");

  String[] results;
  results = caller.getParser().getAsStringArray("wd");
  System.out.println("Mean is " + results[0]);

我检查了一下: 1.安装并加载了RUniversal；2.下载并安装了使用函数的库。3当我将rCaller生成的文件中的RCaller请求放入R中时，它可以工作。4. RScript路径中的斜杠是好的，因为我用注释有问题的行检查了结果，而且它是有效的。

有人能帮我一下吗？

Answer 1

这通常是关于包的安装者和加载者用户的区别。最新的实验性RCaller 2.2.0不需要Runiversal。如果你的问题仍然存在，你可以尝试并在这里写下，如果问题仍然存在，exists.You可以在official blog page of RCaller上点击下载链接

Answer 2

在代码的一部分中

code.addRCode(
      "my.all<-list(mean=my.mean, variance=my.var, sd=my.sd, min=my.min, max=my.max, std=my.standardized)");
caller.setRCode(code);

String[] results;
results = caller.getParser().getAsStringArray("wd");

更改零件

caller.runAndReturnResult("wd");

至

caller.runAndReturnResult("my.all");

因此，您准备好的列表将从R返回到Java。然后使用下面的代码

double[] results;
results = caller.getParser().getAsDoubleArray("mean");

最后，将返回的均值打印到屏幕上

System.out.println("Mean is " + results[0]);