MANOVA -巨型矩阵

Question

首先，很抱歉标签为"ANOVA"，这是关于MANOVA的(尚未成为标签...)

从我发现的教程来看，所有的示例都使用小矩阵，遵循它们对于大矩阵的情况是不可行的，因为许多研究都是这样的。

我为我的14个采样点得到了2个矩阵，1个是生物体ID (4493个ID)，另一个是化学特征(190个变量)。

通过spearman对两个矩阵进行相关，并基于相关性，将其分成4个簇(关于平方欧几里德聚类值的k-均值)，行上的ID和在线上的化学概况。

它们之间的差异在某种程度上是显而易见的，但为了让它更健壮，我想执行MANOVA来显示集群之间和集群内的差异-这当然是得出结论的关键因素。

问题是，经过8小时的尝试，甚至无法以分析可以接受的格式输入数据。

我发现的教程设计的变量很少，即使我认为我克服了这一点，程序也说我的矩阵不能通过它们的长度差异来比较。

每个集群都有自己的ID集，共享所有相同的变量集。

我该怎么办？

提前谢谢。

小川迪奥戈

Answer 1

如果您的数据中有缺失值(实际上所有数据集似乎都包含这些值)，您可以删除这些观测值，或者使用这些观测值创建模型。如果你的方法论让你确信这些观察有一些不同之处，那么就使用第一种方法。大多数情况下，最好使用缺少的值来运行模型。在这种情况下，使用一般线性模型而不是平衡ANOVA模型。平衡模型将很难处理这些缺失的数据。