read.table row.names & col.names错误

Question

这很烦人，我不能理解出什么问题了？

这是我的.csv文件：

            D102-A1 D102-A2
A1BG        0.32    0.39
A1BG-AS1    0.08    0.14

实际外观：

;D102-A1;D102-A2

A1BG;0.32;0.39

A1BG-AS1;0.08;0.14

这是我的代码：

x <- read.table(file = "file.csv", sep = ";", header = TRUE, col.names = 1)

这会产生以下错误：

列数多于列名此外:警告消息: header和'col.names‘的长度不同

第一行是左上角的空单元格，这不应该是页眉吗？当我有一个标题的时候，为什么我不能将第一列设置为row.names？

谢谢!

Answer 1

我不确定，因为我从未使用过R，但我查看了一个手册页面http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-intro.html#The-read_002etable_0028_0029-function，它建议如果没有行标签，则所有数据列都需要列标题。

您是否尝试过：

read.table(file = "file.csv", sep = ";")

然后再看一下结果？

这使我认为您需要在不使用colnames选项的情况下进行测试

为了直接读取整个数据帧，外部文件通常具有特殊的格式。

文件的第一行应该有数据框中每个变量的名称。

文件的每一行都有一个行标签和每个变量的值作为它的第一项。

我想指出的是，注释表明，如果第一列上没有列名，程序将很难解释数据。如果没有列标题，数据将如何命名？

Answer 2

在?read.table中，可选参数col.names是列名的向量。因此，通过指定col.names = 1，您就意味着只有一个名为1的列。

要解决此问题，可以删除col.names参数

test1 <- ";D102-A1;D102-A2
A1BG;0.32;0.39
A1BG-AS1;0.08;0.14"
tf <- tempfile()
writeLines(test1, tf)

x <- read.table(tf, sep=";", header=TRUE)

但是，在第一个“X”中留下了一个单元格作为列名。如果这是可以接受的，那么您可以继续使用它；但如果不是这样，您的数据可能需要再次熔化或修改，但为了给您提供建议，我们需要知道您希望生成的数据帧。