在R中使用sqldf -无法指定正确的用户名

Question

我只是下载了一个名为sqldf的R包，只是为了好玩，但到目前为止还不能正确运行它。当我尝试使用iris数据集执行一些查询时：

sqldf("select * from iris limit 5")

出现错误，声明为Error in mysqlNewConnection(drv, ...) : RS-DBI driver: (Failed to connect to database: Error: Access denied for user 'myUserName'@'localhost' (using password: NO) ) Error in !dbPreExists : invalid argument type

因此，我打开了它的帮助文档，然后运行以下查询：

sqldf("select * from iris limit 5", user="myUser")

错误消息与上面的相同，这意味着在错误消息没有更改为Access denied for user 'myUser'@'localhost')的情况下，我未能正确指定我的user参数。

那么，我如何修复它并正确运行它呢？

当我使用RMySQL时，我使用以下参数来建立连接。

con <- dbConnect(dbDriver("MySQL"),username="myUser",password="myPass",host="myHost",unix.sock="/tmp/mysql.sock",dbname="myDB")

我使用的是OSX10.9.1，使用的是通过homebrew安装的MySQL 5.6，以及R版本3.0.2和sqldf版本0.4-6。

谢谢。

Answer 1

首先，我要确保sqldf可以与SQLLite一起工作。

head(sqldf("select * from iris",drv='SQLite'))

接下来，我强烈建议您始终使用drv=参数或显式设置sqldf.driver变量。依赖于库的顺序(..)调用可能会在以后导致错误。

如果你正在做一些简单的事情，你可以使用SQLLite，因为它速度快，依赖项少(例如，如果你移动你的代码，你不需要安装MySQL)。如果您使用的是Date，那么SQLLite不是很好，所以您可能想要使用MySQL。正如注释和?sqldf底部的注释中所提到的，您需要为mysql a Client部分设置一个my.cnf，以便包括sqldf在内的所有客户端都使用特定的登录。还要确保dbname是这样设置的：

options(sqldf.driver = "RMySQL")
options(RMySQL.dbname = "rtest")
head(sqldf("select * from iris"))

我还没有找到一种在没有my.cnf的情况下使用MySQL的可靠方法。对sqldf使用显式连接对我也不起作用。我认为PostreSQL更好，因为您可以根据文档从R内部设置用户名等。

Answer 2

我遇到了第一个错误，因为在我的例子中，sqldf默认使用mysql。然后，我将它切换到SQLite，它使用以下命令工作。

options(sqldf.driver = "SQLite")

Answer 3

如果您已经加载了sqldf包，请尝试同时分离RMySQL和sqldf包，然后加载package.its works for me。请看我下面的代码

detach(package:RMySQL)
detach(package:sqldf)
library(sqldf)

sqldf("select * from iris limit 5",user="sa", password = "root", host = "192.168.200.182", port=3377)