igraph graph.adjacency weighted=NULL

Question

我试图得到图中带权边的矩阵的加权度分布和未加权度分布。我使用了graph.adjacency函数，例如

newMatrix<-graph.adjacency(matrix, weighted=NULL, mode="undirected", diag=FALSE) 

但是加权论证并没有给出我所期望的结果。例如，对于具有下列值的3x3矩阵：

    [,1][,2][,3]
[1,]  1   2   2
[2,]  2   2   0
[3,]  2   0   3

对于参数weighted=NULL和diag=FALSE，我希望得到一个邻接矩阵，例如：

    [,1][,2][,3]
[1,]  .   1   1
[2,]  1   .   .
[3,]  1   .   .

因此，未加权边向量的度分布将是度(2，1，1)。尽管如此，该函数仍返回一个加权矩阵。返回的邻接矩阵为：

    [,1][,2][,3]
[1,]  .   2   2
[2,]  2   .   .
[3,]  2   .   .

我已经尝试将加权参数更改为TRUE，将de模式更改为min，max...但是结果总是给我返回一个加权矩阵。

Answer 1

当为weight=NULL和mode=undirected时，graph.adjacency将(对称)邻接矩阵的i，j项解释为i，j之间的边数。可以通过更改mode参数来更改这种解释(请参见文档)。

要仅对每条边计数一次(这似乎是您想要执行的操作)，只需重新缩放输入矩阵即可

m <- matrix(c(1,2,2,2,2,0,2,0,3),nrow=3,ncol=3,byrow=TRUE)
mscaled <-ifelse(m>=1,1,0)
newMatrix<-graph.adjacency(mscaled, weighted=NULL, mode="undirected", diag=FALSE)