在R版本3.0.1中使用snpStats

Question

我正在尝试使用R版本3.0.1的snpStats包。当我使用该命令时，我得到以下错误

Warning message:
package ‘snpStats’ is not available (for R version 3.0.1)

但是，当我查看snpStats文档时，在details下看到以下信息：

Details
Package: snpStats
Version: 1.5.6
Date: 2012-03-27
Depends: R(>= 2.10.0), survival, methods, Matrix
Imports: graphics, grDevices, methods, stats, survival, utils, Matrix
Suggests: hexbin
License: GPL-3
URL: http://www-gene.cimr.cam.ac.uk/clayton
Collate: ss.R contingency.table.R convert.R compare.R glm-test.R imputation.R indata.R long.R misc.R ld.R mvtests.R pedfile.R outdata.R plink.R qc.R qq-chisq.R single.R tdt-single.R structure.R xstuff.R zzz.R
LazyLoad: yes
biocViews: Microarray, SNP, GeneticVariability
Packaged: 2012-03-27
Built: R 2.14.1; i686-pc-linux-gnu; 2012-03-27 13:27:08 UTC; unix

Depends: R(>= 2.10.0), survival, methods, Matrix不是意味着它应该在Windows7上的R x64上运行吗

Answer 1

看起来你可能在使用install.packages()？或者尝试安装较旧的版本？

尝试按照Bioconductor网站上的说明进行操作：http://bioconductor.org/packages/2.12/bioc/html/snpStats.html

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("snpStats")