在装有OSX10.7.2的Mac上安装RPostgresql

Question

我正在尝试在mac上安装rpostgresql。我希望能够使用IP地址连接到服务器并将数据读取到数据帧中。我从CRAN下载了这个包，并运行以下代码行：

install.packages('/Users/celenius/Downloads/RPostgreSQL_0.2-1.tar.gz', type='source')

这开始编译程序包，但导致出现以下错误消息：

> install.packages('/Users/celenius/Downloads/RPostgreSQL_0.2-1.tar.gz', type='source')
Installing package(s) into ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.14/Resources/library’
(as ‘lib’ is unspecified)
inferring 'repos = NULL' from the file name
* installing *source* package ‘RPostgreSQL’ ...
** package ‘RPostgreSQL’ successfully unpacked and MD5 sums checked
checking for gcc... gcc
checking for C compiler default output file name... a.out
checking whether the C compiler works... yes
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of executables... 
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc accepts -g... yes
checking for gcc option to accept ISO C89... none needed
checking for pg_config... /usr/bin/pg_config
checking for "/usr/include/libpq-fe.h"... yes
configure: creating ./config.status
config.status: creating src/Makevars
** libs
*** arch - x86_64
gcc-4.2 -arch x86_64 -std=gnu99 -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include/x86_64 -I/usr/include -I/usr/local/include    -fPIC  -g -O2 -c RS-DBI.c -o RS-DBI.o
make: gcc-4.2: No such file or directory
make: *** [RS-DBI.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘RPostgreSQL’
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.14/Resources/library/RPostgreSQL’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘/Users/celenius/Downloads/RPostgreSQL_0.2-1.tar.gz’ had non-zero exit status

我浏览了rpostgresql网页(1，2)上的建议，但很多建议已经有一年多的历史了，所以我想可能会有更新的关于如何安装这个软件包的建议。

Answer 1

如果你想连接到postgre数据库，你也可以使用RODBC。只需安装一个ODBC驱动程序(Lion应该已经包含postgres的驱动程序)，您就可以开始工作了。我这样做是为了连接到我本地的postgre / postgis服务器，它工作得很好。

Answer 2

你需要安装Xcode才能编译。进入Mac应用商店搜索，然后安装Xcode。这是免费的。

您可以通过快速执行which gcc-4.2来判断您是否已经拥有了gcc。我的猜测是你不知道。在安装Xcode之后，你应该会得到/usr/bin/gcc-4.2的响应。

*编辑*

在评论了你是如何安装Xcode的，但是仍然没有安装gcc-4.2之后，我做了一点阅读，看起来你需要做这个堆栈溢出问题中列出的选项之一：Setting GCC 4.2 as the default compiler on Mac OS X Leopard

这让我想知道我的gcc-4.2是从哪里来的。可能是我刚拿到MBP的时候发生的意外。

Answer 3

由于从源代码构建包需要postgresql，因此您需要安装它。如果您使用homebrew，最简单的方法是在终端中执行以下操作：

## install postgresql
brew install postgresql

## install the R package
Rscript -e "install.packages('RPostgreSQL', type = 'source')"

## remove postgresql (optional)
brew remove postgresql