PyFITS:文件已存在

Question

我真的快要完成一大段代码了，但它的最后一部分似乎失败了，我不知道为什么。我在这里尝试做的是取一个图像数组，将它与不同的图像数组进行比较，在初始图像数组等于1的地方，我想在第二个图像数组中屏蔽这一部分。然而，我得到了一个奇怪的错误：

代码：

maskimg='omask'+str(inimgs)[5:16]+'.fits'
newmaskimg=pf.getdata(maskimg)
oimg=pf.getdata(inimgs)
for i in range (newmaskimg.shape[0]):
    for j in range (newmaskimg.shape[1]):
        if newmaskimg[i,j]==1:
            oimg[i,j]=0
pf.writeto('newestmask'+str(inimgs)[5:16]+'.fits',newmaskimg)

错误：

/home/vidur/se_files/fetch_swarp10.py in objmask(inimgs, inwhts, thresh1, thresh2, tfdel, xceng, yceng, outdir, tmpdir)
    122             if newmaskimg[i,j]==1:
    123                 oimg[i,j]=0
--> 124     pf.writeto('newestmask'+str(inimgs)[5:16]+'.fits',newmaskimg)
    125 
    126 

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pyfits/convenience.pyc in writeto(filename, data, header, output_verify, clobber, checksum)
    396         hdu = PrimaryHDU(data, header=header)
    397     hdu.writeto(filename, clobber=clobber, output_verify=output_verify,
--> 398                 checksum=checksum)
    399 
    400 

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pyfits/hdu/base.pyc in writeto(self, name, output_verify, clobber, checksum)
    348         hdulist = HDUList([self])
    349         hdulist.writeto(name, output_verify, clobber=clobber,
--> 350                         checksum=checksum)
    351 
    352     def _get_raw_data(self, shape, code, offset):

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pyfits/hdu/hdulist.pyc in writeto(self, fileobj, output_verify, clobber, checksum)
    651                     os.remove(filename)
    652                 else:
--> 653                     raise IOError("File '%s' already exists." % filename)
    654         elif (hasattr(fileobj, 'len') and fileobj.len > 0):
    655             if clobber:

IOError: File 'newestmaskPHOTOf105w0.fits' already exists.

Answer 1

如果您不关心覆盖现有文件，pyfits.writeto将接受clobber参数以自动覆盖现有文件(它仍将输出警告)：

pyfits.writeto(..., clobber=True)

顺便说一句，让我强调一下，您在上面发布的代码并不是使用Numpy的正确方式。代码中的循环可以在一行中编写，速度会快几个数量级。例如，许多可能性之一是这样写它：

oimg[newmaskimg == 1] = 0

Answer 2

是，添加clobber = True。我以前在我的代码中使用过它，它工作得很好。或者，只需执行sudo rm path/to/file并删除它们，这样您就可以再次运行它。

Answer 3

我遇到了同样的问题，事实证明，使用参数clobber仍然有效，但在未来的AstroPy版本中将不再支持。

参数overwrite做了同样的事情，并且没有输出错误消息。