ggplot2不绘制因为ggsave不保存

Question

我有一个使用pyper库的python脚本(通过管道连接到R)，并且我正在尝试从ggplot2中获得一些输出。我已经尝试了'ggsave‘方法和'device(...)；dev.off()’方法，但没有任何输出。

我不得不使用pyper，因为它使用64位(python和R)，所以rpy2不是我的选择。

代码如下所示：

r("png(filename='test.png',width=720,height=540)")  #comment if ggsave
r("p<-ggplot(DB,aes(X,Y,group=cfg))")
r("""p <- p + geom_path(aes(colour=factor(f1))) + scale_x_log10('X label') +
  scale_y_continuous('Y label',breaks=myb,labels=myl) + 
  geom_point(data=subset(DB,pts==dot),aes(colour=factor(f1),size=factor(f2),
  shape=factor(f3))) + labs(colour='l1',size='l2',shape='l3')""")
r("print(p)")
# r("ggsave(filename='test.png',width=10,height=7.5)   #comment out if using png
r("dev.off()")                # comment if using ggsave

在这两种情况下都不会创建任何文件。我已检查以确保DB数据表有条目(1000)。我能尝试什么呢？

Answer 1

所以这一切都是库和环境变量的问题。一些已加载的库，如ggplot2，不会加载所有依赖项，如摘要库。这个错误只出现在代码的"print(p)“部分。

此外，需要正确设置的x64库位置也存在差异。确保R_HOME和R_LIBS变量与您的配置匹配。

Pyper似乎没有告诉我库没有加载，它只是继续运行，所以qplot最初并没有在R中加载。在将其加载到正确的位置后，您需要确保您始终使用您的用户帐户或管理员帐户(或者您在R_LIBS中有多个路径，但我没有尝试这样做)。

只要加载库，qplot和ggsave就可以正常工作。

感谢所有致力于调试的人员和指导！