问来自管道的Mysqlimport
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Stack Overflow用户

提问于 2013-04-06 03:26:25

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我正在试图弄清楚如何在没有任何运气的情况下将输出输送到mysqlimport中。我有一个很大的文件(大约250 GB)，我想在处理它之后将其通过管道传输到mysqlimport。我不想创建一个中间文件/表。我的想象是这样的：

-uuser genome.mpileup | nawk 'sub("^..."，"")‘| mysqlimport -uuser -ppassword数据库

但显然这是行不通的。对如何实现这一点有什么建议吗？

发布于 2013-04-06 03:41:42

看起来mysqlimport不能从STDIN中读取数据，但您也许可以尝试一下named pipe。类似这样的东西(未经测试)

mkfifo bigfile
mysqlimport -uuser -ppassword Database bigfile &
cat genome | nawk > bigfile

或者，您可以使用an extension来运行命令而不是文件

mysqlimport -uuser -ppassword Database <(cat genome | nawk)

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/15841956

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