获取HDF5数据集的维度

Question

我在我的C++程序中使用了一些HDF5文件，我有一个关于H5Dopen函数的问题。可以在给定文件中获取hdf5数据集的维度吗？

hid_t file, dset;
herr_t status;
file = H5Fopen (filenameField, H5F_ACC_RDONLY, H5P_DEFAULT);
dset = H5Dopen (file, "/xField", H5P_DEFAULT);

在我做下一行之前，我想要得到dset的尺寸。

status = H5Dread (dset, H5T_NATIVE_DOUBLE, H5S_ALL, H5S_ALL, H5P_DEFAULT,  &readBuf[0]);

我只找到了H5Dget_storage_size，但它不适合我的情况。

有人知道怎么做吗？

Answer 1

或者，这可以像这样完成(对于简单的数据空间，请参阅Simons answer，如有必要，请使用bool H5::DataSpace::isSimple() const进行检查)：

  #include "H5Cpp.h"
  using namespace H5;
  //[...]
  DataSpace dataspace(RANK, dims);
  //[...]
  /*
   * Get the number of dimensions in the dataspace.
   */
  const int rank = dataspace.getSimpleExtentNdims();

这一行在大多数情况下可能是多余的，因为整个任务可以在两行中完成：

  /*
   * Get the dimension size of each dimension in the dataspace and
   * store the dimentionality in ndims.
   */
  hsize_t dims_out[rank];
  const int ndims = dataspace.getSimpleExtentDims( dims_out, NULL);

可以作为H5::DataSpace实例的成员调用函数getSimpleExtentNdims()。

这些代码片段取自较新的HDF5 C++ reference manual的examples page (readdata.cpp)。

用h5c++编译所有的东西，它应该可以工作。