R中的Read.table错误

Question

我使用R读取一个文本文件，然后对其进行操作。输入文件有22列。这是第一列的样子：

NAME    LENGTH  A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y

我目前正在使用：

read.table("filename", stringsAsFactors=FALSE) 

来输入文件。当我运行同样的命令时，我会得到这样的警告：

Error in scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings,  : 
  line 2 did not have 23 elements

我不确定我错在哪里。我是R的新手，真的很感谢你的帮助。我试着确认这不是转帖，但如果是转帖，请将我链接到原文。

Answer 1

假设文本文件如下所示：

NAME LENGTH A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y 
ape:APE_0001 242 15 0 1 12 10 18 2 27 9 43 7 2 8 3 5 25 15 24 3 12 
ape:APE_0002 113 7 1 6 6 1 12 3 4 10 16 4 2 4 0 10 3 5 9 4 5 
ape:APE_0004 305 24 2 5 8 9 25 4 36 12 43 8 11 14 2 12 20 21 27 9 12

并将其命名为'dat.txt‘并存储在您的工作目录中，这应该可以正常工作：

dat <- read.table("dat.txt", stringsAsFactors=FALSE, header=TRUE)
# to give:
dat
          NAME LENGTH  A C D  E  F  G H  I  K  L M  N  P Q  R  S  T  V W  Y
1 ape:APE_0001    242 15 0 1 12 10 18 2 27  9 43 7  2  8 3  5 25 15 24 3 12
2 ape:APE_0002    113  7 1 6  6  1 12 3  4 10 16 4  2  4 0 10  3  5  9 4  5
3 ape:APE_0004    305 24 2 5  8  9 25 4 36 12 43 8 11 14 2 12 20 21 27 9 12

由于这似乎对你不起作用，所以在你的文本文件中可能有一些奇怪的和看不见的东西，隐藏的字符，等等。

假设您的文本文件不是很大，一种解决方法是在RStudio中打开一个新的R脚本，然后键入

dat <- read.table(stringsAsFactors=FALSE, header=TRUE, text = "")

然后将文本文件中的所有文本复制并粘贴到上面行中的""之间，而不对换行符或格式进行任何更改，然后选择全部并将其发送到控制台。

对于注释中的示例，如下所示：

dat <- read.table(header=TRUE, stringsAsFactors=FALSE, text = "NAME LENGTH A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y 
ape:APE_0001 242 15 0 1 12 10 18 2 27 9 43 7 2 8 3 5 25 15 24 3 12 
ape:APE_0002 113 7 1 6 6 1 12 3 4 10 16 4 2 4 0 10 3 5 9 4 5 
ape:APE_0004 305 24 2 5 8 9 25 4 36 12 43 8 11 14 2 12 20 21 27 9 12")

如果这不实际或不可能，在你的问题中发布一个指向你的文本文件的链接(比如：http://temp-share.com/show/dPf3a6oHW在45天后自动删除)，这样其他人就可以看到了。