我有一个内部的分布式计算库,我们一直在使用它来进行并行计算工作。在进程分区之后,它们运行数据加载和计算步骤,然后以“保存”步骤结束。通常,这涉及到将数据写入数据库表。
但是对于特定的任务,我需要每个进程的输出都是一个带有一些数据图的.png文件。总共有95个进程,所以有95个.pngs。
在我的“保存”步骤(在每个进程上执行)中,我有一些非常简单的代码,它使用matplotlib的boxplot函数制作箱形图,还有一些代码使用savefig将其写入到一个.png文件中,该文件的名称基于该进程中使用的特定数据的唯一名称。
但是,我偶尔会看到这样的输出:尽管名称是唯一的,但两组或更多组数据似乎写入了同一个输出文件中。
matplotlib在制作框图或保存图形时是否使用临时文件保存?如果是这样,它是否总是使用相同的临时文件名(从而导致覆盖冲突)?我已经使用strace运行了我的进程,但是看不到任何明显看起来像是从matplotlib中写入的临时文件。
我如何确保这将是threadsafe?我当然希望并行保存文件,因为我希望大大扩展输出.pngs的数量,所以首先存储所有数据,然后只串行执行绘图/保存部分的选择是非常不可取的。
我不可能重现我们正在使用的完整并行基础设施,但下面是被调用来创建绘图句柄的函数,然后是被调用来保存绘图的函数。为了解决这个问题,您应该假设线程安全性与我们的分布式库无关。我们知道它不是来自我们的代码,它已经在我们的多处理作业中使用了多年,没有像这样的线程问题(特别是对于我们不能直接控制的东西,比如来自matplotlib的任何临时文件)。
import pandas
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
def plot_category_data(betas, category_name):
"""
Function to organize beta data by date into vectors and pass to box plot
code for producing a single chart of multi-period box plots.
"""
beta_vector_list = []
yms = np.sort(betas.yearmonth.unique())
for ym in yms:
beta_vector_list.append(betas[betas.yearmonth==ym].Beta.values.flatten().tolist())
###
plot_output = plt.boxplot(beta_vector_list)
axs = plt.gcf().gca()
axs.set_xticklabels(betas.FactorDate.unique(), rotation=40, horizontalalignment='right')
axs.set_xlabel("Date")
axs.set_ylabel("Beta")
axs.set_title("%s Beta to BMI Global"%(category_name))
axs.set_ylim((-1.0, 3.0))
return plot_output
### End plot_category_data
def save(self):
"""
Make calls to store the plot to the desired output file.
"""
out_file = self.output_path + "%s.png"%(self.category_name)
fig = plt.gcf()
fig.set_figheight(6.5)
fig.set_figwidth(10)
fig.savefig(out_file, bbox_inches='tight', dpi=150)
print "Finished and stored output file %s"%(out_file)
return None
### End save发布于 2013-01-30 01:05:16
在您的两个函数中,您将调用plt.gcf()。每次使用plt.figure()绘图时,我都会尝试生成一个新的图形,并显式引用该图形,这样您就可以完全回避整个问题。
https://stackoverflow.com/questions/14586764
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