WinBUGS代码中的错误

Question

我无法让下面的WinBUGS代码正常工作。它适用于正常的先验，但不适用于统一的先验。单击compile后出现的错误消息是array index is greater than array upper bound for age。那是什么意思？有谁能帮我完成下面的代码吗？

model
{
for (i in 1:n) {
# Linear regression on logit
logit(p[i]) <- alpha + b.sex*sex[i] + b.age*age[i]
# Likelihood function for each data point
frac[i] ~ dbern(p[i])
}
alpha ~ dunif(0, 1) # Prior for intercept
b.sex ~ dunif(0, 1) # Prior for slope of sex
b.age ~ dunif(0, 1) # Prior for slope of age
}
Data
list(sex=c(1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0,     1,
1, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 1,     1, 0,
0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1,      1, 1,
0, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 1),
age= c(69, 57, 61, 60, 69, 74, 63, 68, 64, 53, 60, 58, 79, 56, 53, 74, 56, 76, 72,
56, 66, 52, 77, 70, 69, 76, 72, 53, 69, 59, 73, 77, 55, 77, 68, 62, 56, 68, 70, 60,
57, 51, 51, 63, 57, 80, 52, 65, 72, 80, 73, 76, 79, 66, 51, 76, 75, 66, 75, 78, 70,
67, 51, 70, 71, 71, 74, 74, 60, 58, 55, 61, 65, 52, 68, 75, 52, 53, 70),
frac=c(1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 1,        0,
1, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1,        1, 1,
1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1,      1, 1,
1, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1),
n=100)
Initial Values
list(alpha=0.5, b.sex=0.5, b.age=0.5)

Answer 1

哦，这很清楚。WinBUGS说是array index is greater than array upper bound for age。这显然暗示了一个错误，我看到你有n = 100，而age列表不够长：

> your_list <- list(...)
> str(your_list)
List of 4
 $ sex : num [1:100] 1 1 1 0 1 1 0 0 0 0 ...
 $ age : num [1:79] 69 57 61 60 69 74 63 68 64 53 ...
 $ frac: num [1:100] 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 ...
 $ n   : num 100

无论如何，我不会在这里使用uniform prior；除非你真正知道自己在做什么，否则我会推荐flat normal，比如dnorm(0, 1.0E-10)或类似的东西。您还应该允许系数为负值。“零假设”通常是系数为零，因此对于系数的后验分布的平均值为零，您应该“从两边给它留出一些空间”(直观地说)。