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Nature|619372人循环代谢性状的遗传分析

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用户8140185
发布2026-09-15 10:37:10
发布2026-09-15 10:37:10
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尽管复杂疾病的全基因组关联研究(GWAS)通常会分析多达100多万人,但分子特征的研究却滞后了。在这里,研究对爱沙尼亚生物库和英国生物库中多达619,372名个体的249个循环代谢特征进行了GWAS荟萃分析。从8,398个趋同于共享基因和通路的位点中鉴定出88,127个常见和低频位点-性状关联。使用统计精细映射、系统表型共定位和顺孟德尔随机化,探索了代谢特征与疾病结果之间的假定因果关系。研究预测,尽管在观察性研究中,血浆支链氨基酸(BCAA)与2型糖尿病有关,,但通过靶向BCAA分解代谢途径降低BCAA水平不太可能降低2型糖尿病的风险。利用我们的大样本量和高质量的基因型插补,发现19.4%的自信精细定位变异的次要等位基因频率在0.1%到1%之间,这些变异在预测的错义和剪接改变变异中富集了两倍。研究结果强调了将低频变异整合到遗传关联研究中的价值。

资源

GWAS pheweb网站

PheWeb提供了对爱沙尼亚生物银行和英国生物银行中249种循环代谢生物标志物的GWAS荟萃分析。该分析基于599,249名主要具有欧洲遗传血统(meta_EUR)的个体。 网址:https://nmrmeta.gi.ut.ee/

核磁共振共定位浏览器ELIXIR

核磁共振共定位浏览器ELIXIR提供了一个简单的界面,用于搜索和探索核磁共振代谢特征共定位结果。使用gpu-coloc,对来自英国生物库+爱沙尼亚生物库249个代谢性状(meta_EUR)的荟萃分析中的所有85,821个全基因组显著信号进行了共定位,以对来自9个来源的广泛GWAS和分子QTL关联。 网址:https://elixir.ut.ee/eqtl/nmr-coloc?coloc_cluster=104

关于爱沙尼亚生物银行EstBB

在过去的二十年里,EstBB经历了几个增长阶段。第一个十年侧重于使用招聘人员(主要是全科医生)和全国生物库管理的特殊招聘办公室进行参与者招聘和数据收集。总共有450名全科医生和约15个招聘办公室参与,到2015年将有52000名参与者。所有人都签署了广泛的同意书,捐献了血液样本,并根据一份问卷接受了采访,该问卷包括大约330个关于生活方式、教育、病史、药物使用和女性健康的问题。广泛的同意允许EstBB通过从爱沙尼亚健康保险基金(EHIF)和国家健康信息系统(NHIS)的国家健康数据库中检索数据,定期更新参与者的记录。EHIF管理国家健康保险,提供医疗服务、药品和医疗设备,使其成为全体人口健康保险数据的主要处理者。国家健康信息系统是爱沙尼亚电子健康生态系统的基石,该生态系统开发和管理电子服务,因此是健康相关信息的枢纽。问卷和与电子健康记录(EHR)的链接提供了1000多个数据字段,涵盖了生活方式、饮食、临床诊断、药物使用和医疗程序1,2。国家健康信息系统还整合了爱沙尼亚医学数字图像库,这是一个用于临床使用的放射学图像和胶片(磁共振成像、计算机断层扫描、心电图、X射线等)的独立数据库。

参考

  • •  Milani, L., Alver, M., Laur, S. et al. The Estonian Biobank’s journey  from biobanking to personalized medicine. Nat Commun 16, 3270 (2025).  https://doi.org/10.1038/s41467-025-58465-3
  • •  Tambets, R., Jesse, M., Kronberg, J. et al. Genetic analysis of  circulating metabolic traits in 619,372 individuals. Nature (2026).  https://doi.org/10.1038/s41586-026-10532-5
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原始发表:2026-05-24,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除
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