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工具推荐 | 支持动物模型中系谱常见的错误检测:个体重复、父母本交叉和系谱循环

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邓飞
发布2026-03-12 18:06:52
发布2026-03-12 18:06:52
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大家好,我是邓飞。

在进行数据分析特别是动物模型计算BLUP值时,会用到系谱数据,原始的系谱数据各种问题,分析起来头大,之前写过一些清洗数据的函数,但是对于很多老师还是门槛太高,今天推荐一个系谱清洗的小工具,直接上传系谱数据,下载分析报告。

比如:

1,上传数据

2,下载结果

3,查看结果

可以看到,上面的系谱有4条,其中个体没有重复,父母本有一个交叉,编号是2。系谱有循环,1的父本是2;1的子代是3;3又是2的父本,构成系谱循环。

这样,常见的系谱错误一键检测出来,666。

工具网址:http://asreml.cn/pedigree-cleaning

注册后就可以使用了。看平台介绍,是基于asreml软件搭建的分析平台,包括单性状动物模型、双性状动物模型、选种配种、遗传进展、家系划分、血缘分析、亲子鉴定、GWAS分析和GS分析,现在平台免费开放使用用,感兴趣的小伙伴不要错过呀。

工具网址:http://asreml.cn/pedigree-cleaning

点击阅读原文,也可以打开。

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原始发表:2025-12-22,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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