滴滴代跑大基因组/转录组分析—数信院

邓飞

发布于 2026-03-12 17:48:58

数信院在线蹲活!甩数据就干!

做科研的你，是否还在为这些问题头疼？

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大基因组的大样本重测序数据量动辄几十G上百G，本地电脑CPU、内存和硬盘空间根本吃不消；

bulkRNA分析卡在质控、定量环节，反复崩溃重开；

想做bulkWGCNA构建共表达网络，却因内存不足直接卡死……

你出数据，数信院出算力和结果！

数信院代分析专治你的算力不足问题！

数信院针对用户大量反映的分析问题，聚焦大基因组大样本重测序上游处理、bulk转录组至差异基因分析、WGCNA共表达网络分析三大核心场景，依托高性能服务器集群，大幅提升科研效率！

我们也接受您提供数据和脚本的代跑方式~

实测数据，算力差异一目了然

数信院实际对比了二者数据处理的差异，整理了三大核心分析场景下两者的算力、时长、内存峰值对比，用数据直观展现服务器的绝对优势（测试基于常见科研数据量，具体以实际样本为准）

分析场景	具体步骤	本地电脑（i7-12700H处理器+16G内存）	数信院服务器（768线程+2.3T内存）	核心优势
大基因组大样本重测序上游处理	原始数据质控（10个样本，每个100G）	时长：1.25-2小时；内存峰值：15G	时长：20分钟；内存峰值：15G	效率提升4-5倍，避免内存溢出导致任务中断
	序列比对+SVcalling（基因组10G）	内存溢出无法进行	时长：3.5小时；内存峰值：30G（并行处理无压力）	多样本并行处理
bulk转录组分析至差异基因	数据过滤+参考基因组比对（10个样本，每个10G）	内存溢出无法进行	时长：1小时；内存峰值：18G（10个样本并行处理）	多样本同时处理，大幅缩短整体周期
	基因表达定量（基于上一步成功）	时长：6-8小时；内存峰值：12G	时长：40分钟-1小时；内存峰值：11.5G	效率提升7-12倍
	差异基因筛选	时长：2小时；内存峰值：8G	时长：10分钟；内存峰值：8G	效率提升8-12倍
WGCNA共表达网络分析	表达矩阵预处理+网络构建（10000个基因，15个样本）	内存溢出无法进行	时长：15分钟；内存峰值：15G（稳定构建）	避免因内存不足导致网络构建失败
	模块识别+Hub基因筛选（基于上一步成功）	时长：3小时；内存峰值：12G	时长：15分钟；内存峰值：12G	效率提升10倍以上，快速锁定核心调控基因

成熟流程+优质结果=高效出活

1.大基因组大样本重测序SVcalling

输入数据：重测序fastq原始数据；

核心流程：fastq 质控过滤→序列比对→ SNP/INDEL 检测（GATK）→输出高质.vcf结果；

为下游变异关联分析、群体遗传研究提供高质量数据支撑

<多样本SNP/INDEL变异检测.vcf结果>

2. bulkRNA分析流程

输入数据：bulkRNA原始fastq数据；

核心流程：数据质控→序列比对→基因表达定量→差异表达分析；

呈现不同实验分组间的基因表达差异，助力快速锁定核心功能基因

<基因定量和差异基因统计>

<差异基因火山图>

3. bulkWGCNA流程

输入数据：基因表达量矩阵、分组或表型数据；

核心流程：表达矩阵预处理→共表达网络构建→模块划分、模块 - 表型关联分析→核心 hub 基因筛选→可视化；

结合上游基因定量，深度挖掘基因间协同作用关系，为解析复杂性状分子调控机制提供有力支撑。

<聚类和模块划分>

<模块 - 表型关联分析>

你出数据，数信院出算力和结果！

不管理你算力不够，还是被样本量、复杂分析和报错难住，都可以交给我们！省时省力又省心，我们也接受您提供数据和脚本的代跑方式~

服务名称	定价标准	输入数据	分析内容
重测序SVcalling流程	1元/G	重测序fastq原始数据、基因组文件	原始fastq数据清洗、序列比对到GATK SNP/INDEL检测的全流程
bulkRNA流程	1.5元/G	bulkRNA-seq原始fastq数据、基因组文件	数据质控、序列比对、基因表达定量、差异表达分析
bulkWGCNA流程	15元/样	表达量矩阵、分组信息或表型信息	表达矩阵预处理、共表达网络构建、模块划分、模块-表型关联分析、核心hub基因筛选及可视化
bulkRNA+bulkWGCNA组合拳	45元/样	bulkRNA-seq原始fastq数据、基因组文件、分组信息或表型信息	涵盖bulkRNA pipeline全流程+bulkWGCNA pipeline全流程