探索SLE：cellxgene数据库在线分析Science期刊发表的系统性红斑狼疮患者外周血单细胞数据集

基因表达分析

网址：https://cellxgene.cziscience.com/gene-expression

选择网页上端的Gene expression 模块，如图所示：

1：Disease 选择normal、systemic lupus erythematosus。这样就可以进行健康对照与SLE之间进行基因表达对比。

2：选择组织来源为blood。因为SLE基因集中只有血液来源数据。

3：Group by 按照Disease 进行分开比较。

4：输入需要查询的基因。

5：可以选择需要查询的细胞类型。

6.保存分析的数据。可以是图片与csv电子表格。

选择特点细胞类型进行比较：

在5所在位置选择细胞类型。如下图所示，有些细胞类型在normal与SLE中均有注释到，因此存在两个组。但有些细胞类型只在normal组注释到，因此无法比较。右侧基因的大小与颜色代表该基因在细胞类型中A中表达的比例与相对表达水平。这个图片结果可知，在B细胞、CD4+T细胞中，IFI44L，OAS1在SLE中表达较高。而foxp3表达差异不明显。

差异基因分析

网页：https://cellxgene.cziscience.com/differential-expression

目的：两个不同细胞类型或者两种不同疾病之间的差异表达基因分析。

举例说明：对SLE与normal之间的外周血抗体分泌细胞进行差异分析

1.选择Differential Expression模块；2：选择SLE与Normal;3:选择blood。4;选择细胞类型（也可以不选择，只进行组织水平比较）。5：点击Find genes;6:差异结果展示与查询界面；7：下载差异分析结果。