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函数及R包

写函数的函数：function

anmy<-funtion(a,b,=a+b)
if(!require(strungr))install.packages("stringr")#如果没有安装包就执行安装，如果没安装就安装
#上述函数可以安装大多数包
#require函数不会出现报错error
if(!require(ggstatsplot))install.packages("ggstatsplot",update=F,ask=F)
#参数避免弹窗

R包安装和使用的逻辑：

安装包的方式选择R软件内函数运行的方式，不要手动下载

install安装包- library加载包-使用包里的函数

安装包后可简化： 包名：：函数名（） 快捷调动包里的函数 省略library步骤

could not found funtion:1)没加载函数的包； 2）存在拼写错误

there is no package called: “x”解决办法：安装包"x"

检查安装包是否成功的唯一标准：library（）

R包不要设置安装包的位置 直接放在默认位置 避免后期找不到

西湖大学的镜像可以解决一些其他镜像下载不了的问题,代码如下

options(BioC_mirror="https://mirrors.westlake.edu.cn/bioconductor")
options("repos"=c(CRAN="https://mirrors.westlake.edu.cn/CRAN/")) 
browseVignettes("limma")#查找函数帮助文件
ls(package:limma)#查询包里面有什么函数及数据

包可以重复安装 不耗费内存 只浪费电量

R包安装问题及解决的网页链接

R包如何使用——获取帮助

（1）软件内查看函数帮助文档 ?函数名

（2） 网页搜索limma package

（3） 函数 browseVignettes("limma")

查询包里面有什么函数及数据 ls(package:limma)

使用Rproject管理工作目录

文件读取

read.csv()

tips：read.table()读取文件报错，可改为 read.delim()尝试（分隔符不同）

R语言规则：行名不允许有重复值 加粗（需自行处理数据：如取平均值）

#一个函数支持读取很多格式，见帮助文档(看不懂报错就放弃哈哈哈，较难)
#excel表格的到导入及导出只建议这种rio包的方式
ex1 = import("ex1.txt")
#一个函数支持导出很多格式，见帮助文档
export(ex1,file = "ex1.xlsx")

sublime软件打开文本文件