Day3-学习R包

1.安装和加载

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))：

• 这行代码设置了R的选项，指定了用于安装R包的CRAN（The Comprehensive R Archive Network）镜像地址。这里选择的是中国清华大学的镜像服务器，这样做的好处是在国内下载R包时速度会更快。options(BioC_mirror="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor/")：
• 这行代码设置了Bioconductor的镜像地址，Bioconductor是一个提供超过1100个R包的生物信息学项目，它与R语言紧密集成。同样，这里选择的也是清华大学的镜像服务器。
• install.packages("dplyr")：
• 这行代码用于安装名为 dplyr 的R包。dplyr 是一个流行的数据操作包，提供了一系列的函数用于快速进行数据操作，如选择、过滤、排序、汇总等。
• library(dplyr)：
• 这行代码加载了之前安装的 dplyr 包，使其函数可以在当前R会话中使用。

安装Rtools包

https://cran.rstudio.com/bin/windows/Rtools/
Installing package into ‘C:/Users/Lenovo/AppData/Local/R/win-library/4.4’

2.熟悉dplyr五个基础函数

mutate() 函数是 dplyr 包提供的一个用于修改数据框（data frame）的函数，它可以创建新的列或者修改现有的列。

mutate(.data, new_column_name = expression)

 mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width)

##在数据框 test 中，创建一个名为 new 的新列，该列的每个值是对应行中 Sepal.Length 和 Sepal.Width 的乘积

select(test,1)

##从数据框 test 中选择第一列。

select() 函数是 dplyr 包提供的一个用于选择数据框（data frame）中特定列的函数。select() 函数的基本语法如下：

select(.data, column_name_1, column_name_2, ...)

• .data：需要选择列的数据框。
• column_name_1，column_name_2，...：你想要从数据框中选择的列的名称。

filter(test, Species == "setosa")

####从数据框 test 中选择setosa行。

filter(.data, condition)

• .data：需要筛选行的数据框。
• condition：一个逻辑表达式，用于判定每行是否应该被包含在结果中。

arrange(test, Sepal.Length)

###按照Sepal.Length列从小到大排序

 summarise(test, mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))

# 计算Sepal.Length的平均值和标准差

引用：生信星球学习小组第169期Day6-学习R包 (umu.cn)