Day 3——Linux 软件安装：conda/miniconda

今日份学习内容

思维导图

将miniconda安装到服务器

##登录你的服务器

##下载miniconda软件

必应搜索“miniconda 清华”，找到链接

miniconda链接

打开后找到最新版本

笔记发布时最新版本

选中-鼠标右键-复制链接-转到xshell-cd ~/biosoft 打开之前建立的biosoft目录-wget 左键-回车，等待下载

安装miniconda

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh，版权信息让enter就enter，让yes就yes

出现 #Thank you for installing Miniconda3!#说明安装成功

激活miniconda

source ~/.bashrc激活conda

执行conda出现满屏信息说明激活成功

添加镜像

复制粘贴以下代码回车

使用北外的镜像

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/ conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/ conda config --set show_channel_urls yes

引自生信星球

使用conda

查看当前服务器安装软件列表

conda list

安装软件

conda install 软件名 -y ,-y#安装过程中所有协议均回答yes

默认最新版本，若指定版本：conda install 软件名=版本信息 -y

确认软件是否安装成功

软件名 --help，若出现软件帮助文档表示安装成功

卸载软件

conda remove 软件名 -y