Cytoscape 作为一名临床狗,接触数据挖掘快1年了,感觉是进入了一个大"坑",学习了很多新的东西。开始的时候总想知道文章里面漂亮的网络图是怎么画的,后来通过网文学习了cytoscape。

Cytoscape:是一款可图形化显示网络并进行分析和编辑的软件。支持多种网络描述格式,也可以用以Tab制表符分隔的文本或Microsoft Excel文件作为输入,或利用软件本身的编辑器模块直接构建网络(关于它的使用,网上已有很多教程了)。


Cytoscape最方便的地方在于它有很多的插件,这些插件可以通过官网上下载(App),导入cytoscape,也可以直接在cytoscape上下载(App manager)我们可以在app manager看到可用的插件有195个,其中大家用得多有(MCODE,cytoHubba,ClueGO, CluePedia,……)。关于这些App的后续文章,将在Chris生命科学小站不定期更新。(Chris Lou 是个很优秀的战友,是他让我有写网文的动力)
真的很感谢随风的投稿,让我觉得不是一个人在战斗,也欢迎大家积极投稿。分享知识,分享快乐,分享正能量与幸福