当R语言遇到plink，就在R中运行plink吧

大家好，我是飞哥。

R语言和plink软件都是常用的软件，随着对软件的熟悉，就不用自己写代码了，直接改代码了，既然改代码，就在一个环境下运行就行了，不想来回切换R和Bash。问题来了：如何在R语言中运行plink软件。

Linux系统下，将plink放到bin文件夹下，直接调用就行，用R语言的system直接调用就行。

Windows系统下，需要一些设置，今天介绍一下。

1，下载plink软件

2，下载R语言

3，将plink.exe文件，放到R语言的bin文件夹下

4，将R语言的路径放到环境变量中

然后就可以在R中调用plink软件了，而且代码放到Linux系统下，也可以直接运行，岂一个爽字了得！

1，下载plink软件

网址：https://www.cog-genomics.org/plink/

然后解压，进入文件夹，找到plink.exe文件。

2，下载安装R语言

网址：https://cran.r-project.org/bin/windows/base/

3，将plink文件放到R中的bin文件夹

默认的安装路径是：C:\Program Files\R\R-4.1.2\bin\x64

将plink.exe文件，放到这里：

4，将R路径放到环境变量里面

找到我的电脑，右键，属性：

找到系统信息，高级系统设置：

找到环境变量

找到Path，双击进入，点击新建，将R中的bin路径放进去：

C:\Program Files\R\R-4.1.2\bin\x64

点击确定即可。

5，测试是否成功

打开Rstudio，新建一个R脚本：

# test plink
system("plink")

运行：

搞定！

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